起床眼睛疼可能是睡眠不足这种非病理因素引起的，也可能是细菌性结膜炎、病毒性角膜炎、青光眼等病理因素造成的。

一、非病理因素

如果患者长时间熬夜，可能会导致睡眠不足，造成眼部疲劳，所以在起床的时候就容易使眼部酸胀疼痛。当患者出现这种情况时，通常不需要进行治疗，平时应避免长时间熬夜。

二、病理因素

1、细菌性结膜炎：如果患者存在细菌性结膜炎，表明眼部存在炎症反应，可能会导致眼睛畏光、分泌物增多等，还可能造成眼部异物感、疼痛等，且疼痛症状比较剧烈。建议患者遵医嘱外用红霉素眼膏、左氧氟沙星滴眼液等药物进行抗菌治疗。

2、病毒性角膜炎：如果身体的免疫功能低下，容易导致角膜的防御能力减弱，还可能造成病毒侵入角膜组织，从而引发病毒性角膜炎，出现眼痛、畏光等症状，伴随视力下降、流泪等情况。建议患者遵医嘱外用更昔洛韦滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等药物进行抗病毒治疗。

3、青光眼：如果患者的眼内房水无法流通，可能会引发眼压升高，导致眼部神经受到损伤，从而引发青光眼，可以表现为眼球胀痛、视力下降、眼球充血等。建议患者遵医嘱使用酒石酸溴莫尼定滴眼液、贝美前列素滴眼液等药物减少房水生成，达到降低眼压的效果。

如果存在起床眼睛疼的情况，建议患者及时前往医院就诊，完善体格检查、眼底检查等，明确病因后再对症治疗，有利于控制病情。在日常生活中，患者需要注意眼部卫生，保护视力，避免出现视疲劳，同时还需要适当进行体育锻炼，如慢跑、跳绳等。