巧克力囊肿怎样治？首先我们要明确巧克力囊肿是什么性质的，如果说它已是以前通过手术治疗发现就是一个卵巢子宫内膜异位症。那么现在囊肿不是很大，小于四公分，我们可以通过药物治疗。但如果是初次就诊，第一次发现，那么我们应该建议患者进行手术剥离，把囊肿取出来，明确它的性质，到底是卵巢的子宫内膜异位症，还是浆液性囊腺瘤还是黏性囊腺瘤。
一般来讲，卵巢巧克力囊肿它有很高的复发率。那么再次来的时候，当囊肿长到一定程度，可以通过超声引导穿刺，把囊内液抽出来，然后再进行相应的药物治疗。总的来讲，卵巢的巧克力囊肿单纯通过药物治疗是效果非常的差非常的低，那么需要做一些物理的干预。比如说超声引导穿刺抽出囊内液或者是做手术把囊肿剥掉进行病理检查，总的来讲，初次发现巧克力囊肿，建议手术治疗，复发可以考虑囊内穿刺抽液，辅助药物治疗。