巧克力囊肿属于卵巢子宫内膜异位囊肿，这种囊肿属于子宫内膜异位症的一种，在怀孕后一般会有所缓解，但是不一定会在怀孕期间消失。如果怀孕前就已经患有巧克力囊肿，并且囊肿的直径很小症状不严重可以让患者先怀孕。如果怀孕前囊肿的体积已经大于五厘米，而且影响了输卵管功能会导致不孕症的发生，所以建议先积极的治疗巧克力囊肿后再进行备孕。女性在平时日常生活中应该避免巧克力囊肿的发生。在平时要做好日常的预防工作，月经期要禁止性生活，因为月经期间进行性生活容易引起经血的逆流，从而引起盆腔子宫内膜异位症，甚至巧克力囊肿的发生，在月经期间也应该注意腹部的保暖。

目前临床上对于卵巢巧克力囊肿，如果小的时候或者是囊肿的大小在五厘米以下，可以暂时不用考虑手术治疗，可以先尝试用中医中药来进行治疗，也可以选择某些中成药来控制囊肿的生长。但是如果中药治疗效果不理想，可以在医生的指导下给予促性腺激素释放激素，来从中枢上控制激素的水平，从而使月经停闭达到抑制子宫内膜活性以及生长的目的，从而使卵巢巧克力囊肿得到治疗。但是这种治疗是有一定的副作用的，往往用药三个月以后患者会出现潮热、出汗、心烦、失眠等植物神经紊乱、更年期的症状。当停药几个月后，子宫内膜又会重新生长卵巢功能重新建立，又会来月经那么移位的病灶有可能重新复发。

巧克力囊肿手术后是否影响生育，需要了解清楚手术的过程，如果患者没有生育过，临床医生一般会考虑患者有生育需求，尽量保留患者的生育能力。如果仅仅是切除了一侧的卵巢和输卵管的话，对侧仍然有卵巢，输卵管仍然可以正常怀孕的，只不过怀孕的几率会稍微的降低。对于卵巢巧克力囊肿有可能不需要切除输卵管和卵巢，仅仅去把囊液吸出，囊皮切掉病灶切除，则不会影响女性的生育。女性仍然在手术后可以正常的生育的，建议夫妻双方如果有备孕计划的话，可以在排卵期前后进行性生活。

巧克力囊肿的患者可以怀孕，由于巧克力囊肿的异位病灶，对卵巢的破坏比较大，影响到卵巢的排卵，患者受孕比较困难。患者的症状较轻微，有自然受孕的几率要及早的受孕。试孕半年以上不能够正常的受孕，患者要根据彩超、CT以及妇科检查等各种情况，在排除其他原因导致的不能怀孕的情况下，选择进行手术或药物治疗。患者选择手术治疗巧克力囊肿，一般术后要配合药物治疗3个月，治疗之后患者要尽早的怀孕。巧克力囊肿容易复发，而且反复的手术对卵巢的破坏比较大，不利于患者的受孕。如果经过治疗之后不能正常的受孕，建议患者可以选择辅助生殖技术。

卵巢巧克力囊肿能根治吗？首先，我们应该知道。这个卵巢巧囊肿是什么性质的？如果是说卵巢的子宫内膜异位囊肿，或者是卵巢的浆液性囊腺瘤或者粘液性囊腺瘤伴随囊内出血造成的卵巢巧克力囊肿，那么在处理的时候，如果说单纯把囊肿剥掉，从正常的卵巢组织上，单纯的把囊肿剥掉，只能说我这一次我把卵巢的囊肿给它剥掉了，算是治疗了，但是留着正常卵巢组织就有可能还会复发，真正的根治就是把卵巢切掉，如果说这个患者已经绝经了，卵巢已经没有分泌雌性激素水平的这种功能了，那么我切除卵巢，我可以达到根治的效果，但是如果这个患者还是生育年龄的妇女，卵巢还有分泌雌性激素，对于她的内分泌有非常重要的影响，这个时候我就不能去做根治性的手术，因为我们还要权衡患者的利弊，如果说我真的把卵巢完全切掉了，虽然囊肿根治了，但是伴随着患者出现了其它一些更年期的症状，可能要比卵巢巧克力囊肿对患者的影响更大。