在临床上，引起肛门坠胀的原因很多，通常包括两大类疾病，第一大类疾病是原发于肛门周围会阴部的疾病，主要包括肛门局部病变，或者是周围疾病，比如泌尿系疾病，原发性的肛门局部疾病，主要是见于痔疮肛裂肛周脓肿。或者是直肠肛管的肿瘤，比如直肠癌，或者肛管癌。
肛门周围邻近系统，主要是泌尿系统疾病。常见的原因主要是泌尿系感染，比如膀胱炎，尿道炎，或者是急性慢性前列腺炎。
对于继发性的引起肛门坠胀的原因，主要见于腹腔内化脓性疾病。脓液流入到盆腔，积聚盆腔引起的直肠肛管刺激症状，临床上又称为里急后重，常见的病因主要包括消化性溃疡穿孔，急性化脓性阑尾炎，或者急性化脓性胆囊炎。通常需要进一步行，腹部B超和CT检查，以明确诊断。对于继发性的引起肛门坠胀的疾病，通常需要及时的手术治疗。