肛门息肉的治疗根据息肉的成分选择，对于炎症息肉的处理主要是避免诱发因素或采用内镜下电灼或局部切除，对于肿瘤性息肉建议手术完整切除。
肛门息肉是直肠肛管常见的疾病，根据息肉成分主要分为炎症性息肉和肿瘤性息肉。一般来说，炎症性息肉直径通常比较小。直径一般不超过零点五公分，可以是单发，也可以是多发。炎症因素主要与进食油腻辛辣刺激食物，引起直肠炎或肛门炎。而导致黏膜破坏，出现了炎症反应有关系，因此，避免进食过于油腻辛辣刺激食物，多进食高纤维素食物，多饮水，保持大便的松软通胀，以减轻或者治愈直肠炎或者肛周炎，对于微小炎症性息肉可以采用内镜下电灼或者局部切除，就可以达到治愈。
而对于肿瘤性息肉，在临床上最常见的是绒毛状管状腺瘤，通常是宽基底型的。理论上来说，绒毛状管状腺瘤有一定的恶变可能，临床治疗上首选，手术完整切除一般需要切除到粘膜下层，并送冰冻排除恶变可能，如果证实恶变的话，通常还需要加做恶性肿瘤根治切除手术。